More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1875 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
545 aa  1035    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.85 
 
 
541 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
536 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
1057 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.88 
 
 
530 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
528 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
536 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  44.35 
 
 
507 aa  291  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  41.59 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
523 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
511 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
530 aa  227  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
521 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
521 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  38.06 
 
 
515 aa  208  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
521 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
521 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
514 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
511 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
515 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
540 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.45 
 
 
567 aa  181  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
550 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.14 
 
 
521 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  31.45 
 
 
541 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
568 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
570 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  31.72 
 
 
541 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 
533 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
512 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
559 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
558 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
549 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
562 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
558 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 
562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
566 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
558 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.59 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
544 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
522 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  32.21 
 
 
543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
530 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
562 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
562 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
544 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
544 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  37.29 
 
 
570 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
543 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 
541 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  36.89 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  36.89 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  36.89 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  36.66 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  32.07 
 
 
559 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
550 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
544 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 
538 aa  157  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 
568 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
574 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
503 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.58 
 
 
555 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 
543 aa  154  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
582 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
526 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
526 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
526 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
536 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
534 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
550 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
555 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
550 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33.53 
 
 
589 aa  150  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.41 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  35.61 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
543 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
526 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
543 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
563 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
543 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
542 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  31.72 
 
 
529 aa  144  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.16 
 
 
543 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>