More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0134 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
558 aa  1090    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.22 
 
 
559 aa  699    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  63.97 
 
 
559 aa  619  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
562 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.88 
 
 
589 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.91 
 
 
555 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 
567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
562 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.43 
 
 
554 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.78 
 
 
574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.01 
 
 
558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.29 
 
 
553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
562 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
560 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
560 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
546 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 
557 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.96 
 
 
545 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.38 
 
 
557 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  48.48 
 
 
557 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  47.52 
 
 
543 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
543 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
528 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
543 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
544 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
544 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
570 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  38.51 
 
 
541 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
544 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  38.12 
 
 
541 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
544 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 
543 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 
541 aa  382  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.26 
 
 
567 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
544 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
543 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
543 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
543 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
566 aa  365  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
543 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
543 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
550 aa  359  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
549 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.97 
 
 
550 aa  355  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
543 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 
540 aa  346  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
582 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.34 
 
 
589 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.76 
 
 
555 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  36.66 
 
 
555 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
589 aa  342  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
562 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
569 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  38.4 
 
 
543 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
542 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
538 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  42.94 
 
 
538 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
542 aa  333  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
558 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
538 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
536 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
564 aa  327  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
562 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
562 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
550 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 
550 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
562 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 
548 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
544 aa  321  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
542 aa  320  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  39.81 
 
 
553 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
533 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.94 
 
 
538 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  44.17 
 
 
570 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  42.23 
 
 
529 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.71 
 
 
543 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
540 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  44.64 
 
 
568 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  44.17 
 
 
570 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  44.17 
 
 
570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  44.17 
 
 
570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  44.17 
 
 
570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 
570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.68 
 
 
558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  44.42 
 
 
548 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  48.82 
 
 
537 aa  300  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
556 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>