More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0914 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.75 
 
 
548 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.87 
 
 
540 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.11 
 
 
552 aa  786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
558 aa  1058    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.61 
 
 
541 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.25 
 
 
555 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.3 
 
 
544 aa  791    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.59 
 
 
536 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  64.56 
 
 
537 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.23 
 
 
543 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
562 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
555 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
546 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
574 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
567 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.6 
 
 
545 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
560 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
560 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
528 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
554 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  45.16 
 
 
559 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  45.2 
 
 
543 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
559 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
589 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
562 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
562 aa  349  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.68 
 
 
558 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.86 
 
 
567 aa  343  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  45.88 
 
 
529 aa  334  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.77 
 
 
558 aa  333  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  36.11 
 
 
541 aa  333  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  35.93 
 
 
541 aa  333  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
544 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
544 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
553 aa  329  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
544 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
543 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 
541 aa  320  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
544 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
557 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
557 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
543 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  45.57 
 
 
557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
543 aa  312  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  41.98 
 
 
553 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
562 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
543 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  34.46 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
568 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
569 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
550 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
543 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.62 
 
 
562 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
521 aa  297  4e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
550 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
558 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  43.47 
 
 
538 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
538 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
543 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
543 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
562 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
562 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
542 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.86 
 
 
539 aa  293  7e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
558 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  40.23 
 
 
589 aa  291  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.48 
 
 
555 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.04 
 
 
589 aa  289  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
549 aa  286  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  43.56 
 
 
538 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  36.13 
 
 
543 aa  280  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
582 aa  279  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.47 
 
 
538 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.41 
 
 
532 aa  278  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
570 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
550 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
543 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  43.09 
 
 
539 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
542 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  43.42 
 
 
570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
540 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
566 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
542 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
540 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
540 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.14 
 
 
568 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  43.42 
 
 
570 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  43.42 
 
 
570 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 
570 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  43.42 
 
 
570 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
561 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  34.65 
 
 
564 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  43.22 
 
 
570 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
536 aa  259  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.674614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  41.39 
 
 
548 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>