More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0163 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.46 
 
 		 557 aa  1067    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  100 
 
 		 557 aa  1075    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.77 
 
 		 557 aa  948    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 		 562 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 		 562 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.56 
 
 		 558 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 		 562 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.22 
 
 		 589 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 		 567 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.14 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 		 558 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 		 574 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.99 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 560 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 560 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 		 544 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 		 544 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  39.17 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.1 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 		 543 aa  389  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  46.54 
 
 		 543 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  39.55 
 
 		 541 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 569 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  45.19 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 		 543 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 		 543 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  41.07 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 		 589 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 543 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.66 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 		 562 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.47 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 		 562 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  45.76 
 
 		 562 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 		 550 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.75 
 
 		 558 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 		 558 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  39.11 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 		 562 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 		 550 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 		 549 aa  326  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  38.25 
 
 		 543 aa  324  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 550 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 542 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 		 550 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 		 548 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 		 565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 		 579 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 552 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  44.76 
 
 		 568 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  45.35 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 538 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  45.23 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  45.23 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  45.23 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  38.71 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  45.23 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  45.04 
 
 		 570 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 		 540 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.99 
 
 		 555 aa  300  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 		 550 aa  299  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.26 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 542 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  44.17 
 
 		 548 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 533 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 		 538 aa  290  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  40.84 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 		 506 aa  289  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 548 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  32.23 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.14 
 
 		 538 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  40.75 
 
 		 538 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 540 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.08 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>