More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2023 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  100 
 
 		 559 aa  1100    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.23 
 
 		 559 aa  758    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.79 
 
 		 558 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.55 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.35 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.74 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.65 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.86 
 
 		 545 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.15 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  48.37 
 
 		 543 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  38.59 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  38.03 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  45.57 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.92 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 		 543 aa  362  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 		 543 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  39.7 
 
 		 543 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 544 aa  356  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 		 566 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 543 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  37.8 
 
 		 555 aa  350  6e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 		 568 aa  349  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 		 543 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 		 582 aa  346  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 		 550 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.47 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.47 
 
 		 552 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 		 543 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  44 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  44.58 
 
 		 538 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 538 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 		 542 aa  333  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 542 aa  333  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.44 
 
 		 558 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 		 555 aa  331  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.86 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  40.26 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  40.3 
 
 		 589 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  44.14 
 
 		 562 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.21 
 
 		 538 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 		 564 aa  321  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 		 550 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 		 561 aa  317  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 		 558 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  42 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 		 543 aa  312  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 		 569 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 		 565 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 		 558 aa  310  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 		 562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 		 542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 		 536 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 		 550 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 540 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.96 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 533 aa  303  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 521 aa  300  6e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 		 533 aa  299  8e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 		 539 aa  297  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 		 565 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 		 550 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 		 539 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  42.42 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.61 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  42.42 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  42.42 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  42.42 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>