More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1546 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.17 
 
 		 533 aa  707    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 564 aa  1127    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.63 
 
 		 561 aa  1088    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.84 
 
 		 567 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  48.37 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  42.21 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 		 549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.97 
 
 		 538 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  46.11 
 
 		 538 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.18 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.38 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.88 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 		 538 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 		 556 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 554 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 		 539 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 		 562 aa  337  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 		 589 aa  329  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 		 559 aa  326  9e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 555 aa  323  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 		 567 aa  320  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 543 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 		 544 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 543 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 544 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 544 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  36.38 
 
 		 559 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.16 
 
 		 558 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 543 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 		 543 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  31.17 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  30.86 
 
 		 541 aa  286  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 		 543 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.62 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  34.08 
 
 		 543 aa  273  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  33.09 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 		 582 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  28.6 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 		 543 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 		 562 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 		 562 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 		 569 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 		 565 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  34.12 
 
 		 557 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 		 562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 		 558 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 		 506 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 589 aa  243  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.07 
 
 		 589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 		 550 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 550 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 		 550 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 		 550 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 521 aa  229  9e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.46 
 
 		 539 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 526 aa  226  6e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 		 552 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  33.93 
 
 		 570 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  33.73 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 		 544 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  33.53 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>