More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0743 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 544 aa  1073    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.53 
 
 		 544 aa  913    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.5 
 
 		 543 aa  944    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.9 
 
 		 543 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.09 
 
 		 543 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.45 
 
 		 543 aa  786    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.77 
 
 		 543 aa  916    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.49 
 
 		 544 aa  1023    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.67 
 
 		 544 aa  1025    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.98 
 
 		 543 aa  790    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  66.85 
 
 		 542 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.38 
 
 		 543 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.85 
 
 		 544 aa  1029    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.95 
 
 		 543 aa  917    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.13 
 
 		 543 aa  940    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  53.08 
 
 		 541 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  53.64 
 
 		 541 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  53.54 
 
 		 543 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  54.13 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  49.54 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  50.93 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 		 562 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  45.34 
 
 		 543 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 562 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.83 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.88 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 		 574 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.1 
 
 		 528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.15 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.11 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  41.23 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  40.99 
 
 		 559 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 		 582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.94 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 		 549 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 		 566 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 		 538 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.39 
 
 		 538 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 		 540 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 		 540 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  41.68 
 
 		 538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 		 589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.04 
 
 		 589 aa  336  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  42.83 
 
 		 538 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 		 550 aa  335  9e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 		 540 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.835608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.17 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  39.22 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 562 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 562 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 550 aa  323  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.96 
 
 		 565 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  34.59 
 
 		 564 aa  317  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 558 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  38.31 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 552 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 		 539 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 544 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 		 541 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 		 506 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 		 536 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.96 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 550 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 		 520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 550 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  41.65 
 
 		 537 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>