More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2834 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 520 aa  1033    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 		 535 aa  588  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  36.97 
 
 		 541 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  36.16 
 
 		 541 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 		 561 aa  289  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.835608  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 544 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 541 aa  287  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  35.8 
 
 		 555 aa  280  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  36.06 
 
 		 543 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.38 
 
 		 544 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.38 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 543 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 543 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 		 543 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 		 562 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 		 559 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 		 562 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  30.94 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.98 
 
 		 567 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 518 aa  193  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.15 
 
 		 558 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  30.17 
 
 		 559 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  26.95 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.33 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 		 561 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 		 538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 		 562 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 		 555 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  31.27 
 
 		 543 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 		 570 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.42 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 		 538 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  29.22 
 
 		 557 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  23.94 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 		 574 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 		 540 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.1 
 
 		 555 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.56 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 		 562 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 		 562 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 		 546 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 		 538 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 		 582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.46 
 
 		 589 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 		 550 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.75 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 544 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1086  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.8 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0627079  normal  0.556717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>