More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0167 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  98.7 
 
 
538 aa  1051    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  100 
 
 
538 aa  1063    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  99.26 
 
 
538 aa  1058    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 
518 aa  481  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
526 aa  332  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  36.25 
 
 
533 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.57 
 
 
528 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
554 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
589 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
559 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
562 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
562 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
560 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
560 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
544 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
546 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  31.66 
 
 
559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.81 
 
 
553 aa  253  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
555 aa  253  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
544 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.56 
 
 
545 aa  250  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.13 
 
 
562 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
544 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
550 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  28.44 
 
 
541 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
544 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
550 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  28.34 
 
 
541 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
568 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  29.53 
 
 
555 aa  239  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
521 aa  238  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
567 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
543 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  29.9 
 
 
543 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.88 
 
 
567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.41 
 
 
555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 
557 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
557 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  26.78 
 
 
557 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
538 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
543 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.88 
 
 
539 aa  229  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.19 
 
 
538 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
543 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
540 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
538 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
540 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
561 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  28.48 
 
 
564 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
540 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  30.28 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
574 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
543 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
543 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  27.78 
 
 
553 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1822  putative iron ABC transporter  29.81 
 
 
528 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.066661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
556 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
570 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33 
 
 
532 aa  218  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
542 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
539 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05461  putative iron ABC transporter  29.02 
 
 
528 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.613032  normal  0.31003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
549 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
544 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
552 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 
541 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
543 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
533 aa  212  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
582 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
542 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
548 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
540 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
543 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
543 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.72 
 
 
558 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
561 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
569 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
589 aa  204  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.97 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
543 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
548 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  27.56 
 
 
562 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  28.46 
 
 
543 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05531  putative iron ABC transporter  30.02 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.103607  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05451  putative iron ABC transporter  29.05 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.302928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
562 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
562 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0490  putative iron ABC transporter  28.38 
 
 
512 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.643  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05161  putative iron ABC transporter  28.6 
 
 
461 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
558 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
536 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.945562  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
565 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04901  putative iron ABC transporter  27.57 
 
 
518 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.268629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>