More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0317 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 570 aa  1127    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  45.64 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 		 557 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  47.17 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.13 
 
 		 562 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.28 
 
 		 558 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.97 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  40.3 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  43.18 
 
 		 589 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  40.19 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 		 550 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.99 
 
 		 589 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 562 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 		 543 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.49 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  42.64 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 		 555 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 		 528 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.96 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.83 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 550 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  41.46 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 		 543 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 		 543 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  40 
 
 		 543 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 		 550 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 546 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 		 543 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.07 
 
 		 553 aa  359  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 		 543 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 		 543 aa  353  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 		 548 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 		 579 aa  347  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.09 
 
 		 542 aa  347  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.86 
 
 		 567 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 		 506 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  44.08 
 
 		 570 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  44.08 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  44.23 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  44.08 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  44.08 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.45 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 		 550 aa  335  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  36.55 
 
 		 555 aa  333  6e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  43.89 
 
 		 548 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 		 549 aa  309  9e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 568 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.96 
 
 		 555 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 533 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  34.77 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 542 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 561 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 538 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  36.05 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.76 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 		 538 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 		 550 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 540 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  38.15 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 540 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>