More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1438 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.84 
 
 		 548 aa  792    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.77 
 
 		 545 aa  772    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 548 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.14 
 
 		 559 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0471935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  45.94 
 
 		 589 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  50.58 
 
 		 562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 		 562 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 		 562 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.29 
 
 		 565 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.58 
 
 		 553 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.39 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.74 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.8 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 		 579 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 		 550 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  47.67 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  47.86 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  47.67 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  47.67 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  47.67 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  47.67 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  47.67 
 
 		 570 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 565 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 		 570 aa  359  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  47.72 
 
 		 548 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 		 562 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  41.43 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.05 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 		 528 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 		 560 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 		 560 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.45 
 
 		 544 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 559 aa  323  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 562 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 		 555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 543 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 		 543 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 544 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  41.39 
 
 		 559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  42.2 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 543 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  33.65 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.48 
 
 		 543 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  33.08 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.48 
 
 		 543 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.92 
 
 		 545 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 542 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  34.02 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  36.72 
 
 		 543 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.64 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 568 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 		 543 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 542 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  37.34 
 
 		 553 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 		 533 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.83 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 538 aa  249  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  36.93 
 
 		 529 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 521 aa  243  7e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 		 561 aa  243  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  32 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.665104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 538 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 		 540 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>