More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2271 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
523 aa  991    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.62 
 
 
530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
530 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
536 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 
528 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
543 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
521 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
521 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
521 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
500 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
536 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
526 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
540 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
509 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
526 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
526 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
512 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.68 
 
 
521 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
522 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
536 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.36 
 
 
521 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
530 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  40.37 
 
 
515 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 
502 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
534 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
534 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
526 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  39.88 
 
 
1057 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
536 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
545 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
511 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
530 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
540 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
527 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  37.58 
 
 
507 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
514 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
526 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
528 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
557 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
528 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
527 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
503 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  36.85 
 
 
528 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
515 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.19 
 
 
531 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  36.82 
 
 
513 aa  220  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
532 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
525 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
525 aa  198  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
530 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
549 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.89 
 
 
567 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
533 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
538 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.26 
 
 
568 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  29.66 
 
 
564 aa  170  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
554 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
561 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.2 
 
 
538 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  32.76 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.02 
 
 
533 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
540 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.87 
 
 
555 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
540 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.08 
 
 
553 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
538 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  29.74 
 
 
555 aa  160  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  29.92 
 
 
541 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
528 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
544 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
544 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
544 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
557 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  29.73 
 
 
541 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  31.89 
 
 
529 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
565 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
538 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
556 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
542 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
543 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
560 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
560 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
557 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
544 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
506 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.17 
 
 
539 aa  150  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  32.92 
 
 
557 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
543 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
562 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
559 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
543 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.81 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
570 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>