More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  100 
 
 
512 aa  985    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.46 
 
 
521 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.4 
 
 
521 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.4 
 
 
521 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.11 
 
 
521 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.69 
 
 
521 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.9 
 
 
509 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.69 
 
 
518 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
536 aa  346  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.38 
 
 
500 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.98 
 
 
503 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
534 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
526 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
526 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
522 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
530 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.16 
 
 
531 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
526 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
530 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 
502 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
536 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
527 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
536 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
525 aa  296  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
532 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
527 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 
528 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
528 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  40.56 
 
 
528 aa  290  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
511 aa  290  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
533 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  41.05 
 
 
515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
523 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
515 aa  276  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  37.97 
 
 
513 aa  276  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
530 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
543 aa  248  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
557 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
511 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
514 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
1057 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
540 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
567 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  36.79 
 
 
507 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
550 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
506 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
549 aa  183  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
545 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
530 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 
555 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  33.2 
 
 
529 aa  171  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
538 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
538 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.61 
 
 
550 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.44 
 
 
553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  29.12 
 
 
564 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
554 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
561 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
542 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
562 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
540 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
550 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.01 
 
 
538 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
539 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
540 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
540 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
538 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
544 aa  156  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  27.21 
 
 
555 aa  155  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  31.43 
 
 
543 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
544 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
544 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0154  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.99 
 
 
539 aa  150  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.234714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  30.19 
 
 
575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 
521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  30.56 
 
 
589 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
533 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
589 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
528 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
559 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 
542 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
544 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
559 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
566 aa  144  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
561 aa  143  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  25.57 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>