More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1555 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
561 aa  1086    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
563 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  28.81 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
559 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
556 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
556 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
616 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 
556 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  28.81 
 
 
556 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  28.81 
 
 
556 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
556 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  28.81 
 
 
556 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  28.63 
 
 
556 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 
556 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  31.2 
 
 
575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
608 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
568 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
611 aa  179  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  29.74 
 
 
585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  30.44 
 
 
589 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.26 
 
 
589 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
547 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  30.26 
 
 
589 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  29.5 
 
 
590 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
569 aa  170  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
551 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
576 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
551 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
590 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
569 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
589 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
551 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
605 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
590 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
590 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
564 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
560 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
563 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 
543 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
590 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
564 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
590 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
590 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
557 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  29.15 
 
 
589 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  28.52 
 
 
685 aa  155  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
608 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
566 aa  153  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
597 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
700 aa  150  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
579 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  26.96 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 
602 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
692 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
758 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
545 aa  143  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  29.52 
 
 
578 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
692 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
741 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
603 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 
741 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 
554 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  26.18 
 
 
589 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
589 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
589 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
603 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.26 
 
 
521 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  26.21 
 
 
603 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
521 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
545 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
740 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.26 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 
743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
559 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
586 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
741 aa  133  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.2 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
742 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
692 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.98 
 
 
587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
572 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>