More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2889 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
543 aa  1075    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
530 aa  359  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
528 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
540 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 
557 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  40 
 
 
1057 aa  266  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.7 
 
 
515 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
509 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
536 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
540 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.08 
 
 
567 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
502 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
550 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
518 aa  236  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
545 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
511 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
521 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
521 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 
533 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
521 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
549 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
589 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
503 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
554 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
561 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.08 
 
 
555 aa  220  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  31.35 
 
 
564 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  30.06 
 
 
541 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  29.87 
 
 
541 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.46 
 
 
521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 
538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
562 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
562 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
530 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
544 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 
512 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
555 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
540 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
546 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
558 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
515 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
544 aa  206  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
544 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
540 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
543 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
543 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
528 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.71 
 
 
538 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
544 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
540 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
543 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.44 
 
 
562 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
544 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
559 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  31.73 
 
 
553 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
533 aa  200  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 
534 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  29.85 
 
 
555 aa  197  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
567 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  29.73 
 
 
543 aa  196  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
543 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
550 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
511 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
556 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
543 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
534 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
543 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
570 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
543 aa  193  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  31.91 
 
 
559 aa  193  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  32.56 
 
 
543 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
565 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
553 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  31.49 
 
 
529 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  31.83 
 
 
557 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
569 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
557 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 
532 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
550 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.21 
 
 
545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
566 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>