More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1174 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
528 aa  986    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.25 
 
 
530 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.51 
 
 
536 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.41 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.46 
 
 
536 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
543 aa  359  8e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
545 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
1057 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.8 
 
 
511 aa  333  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 
502 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
530 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
521 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
521 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
521 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.65 
 
 
521 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  45.45 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
512 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
511 aa  300  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.58 
 
 
521 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
518 aa  290  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
509 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
515 aa  280  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
514 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
540 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
536 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 
534 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
534 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
522 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
557 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  39.57 
 
 
507 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
526 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
526 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
526 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.78 
 
 
531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
526 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
530 aa  243  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
500 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
532 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
526 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
530 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
549 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.79 
 
 
550 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
568 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  35.81 
 
 
513 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
536 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
525 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
527 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
533 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  34.33 
 
 
529 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 
538 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
540 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
540 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
540 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.25 
 
 
555 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
538 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.2 
 
 
567 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
525 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
546 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
527 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
559 aa  206  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
574 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 
538 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  33.71 
 
 
528 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
528 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
528 aa  203  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
556 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.6 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  32.82 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 
533 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
562 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  36.07 
 
 
553 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
544 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
544 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  31.1 
 
 
541 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
562 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
561 aa  193  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.59 
 
 
544 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
544 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  36.15 
 
 
543 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
554 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
506 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
553 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  30.37 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  29.22 
 
 
564 aa  190  7e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
560 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
560 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
543 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.23 
 
 
558 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  33.2 
 
 
543 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.17 
 
 
538 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
543 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
533 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
544 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>