More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0827 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
571 aa  1123    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
561 aa  161  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
589 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  26.19 
 
 
585 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  26.37 
 
 
589 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.79 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
589 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.7 
 
 
590 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.56 
 
 
590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  25.56 
 
 
589 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
590 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 
590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 
590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
590 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.91 
 
 
590 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
563 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
568 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  25.34 
 
 
575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.72 
 
 
558 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  25 
 
 
603 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
603 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
557 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  23.93 
 
 
589 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.93 
 
 
589 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 
589 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  25.09 
 
 
578 aa  103  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
568 aa  103  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
603 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.4 
 
 
575 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.26 
 
 
579 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.86 
 
 
605 aa  97.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.17 
 
 
567 aa  91.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
564 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.14 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.57 
 
 
543 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.62 
 
 
609 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
564 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.94 
 
 
572 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  22.84 
 
 
572 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.26 
 
 
569 aa  82.4  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  24.39 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.49 
 
 
559 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 
536 aa  78.2  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.37 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.32 
 
 
611 aa  77  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.34 
 
 
541 aa  77  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.05 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  21.83 
 
 
543 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.81 
 
 
543 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.29 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
534 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.92 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 
692 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.92 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.16 
 
 
589 aa  70.1  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.17 
 
 
521 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  23.58 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.96 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 
700 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.47 
 
 
570 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.16 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 
530 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
544 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.15 
 
 
692 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 
544 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.34 
 
 
608 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.87 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.87 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.6 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.61 
 
 
545 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07081  putative iron ABC transporter  23.7 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.07 
 
 
569 aa  66.6  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.64 
 
 
544 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.69 
 
 
563 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.88 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.8 
 
 
558 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.15 
 
 
692 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>