More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4535 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
579 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  40.39 
 
 
572 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  31.16 
 
 
585 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  32.03 
 
 
590 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
589 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  31.66 
 
 
589 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.66 
 
 
589 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
590 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
590 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
589 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
590 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
590 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
590 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  31.67 
 
 
589 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
557 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
589 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
589 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
589 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  29.31 
 
 
589 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  28.84 
 
 
603 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
603 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
603 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 
597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
561 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
561 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
563 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
558 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  27.4 
 
 
575 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.13 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  24.95 
 
 
578 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
592 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 
563 aa  137  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.29 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.74 
 
 
551 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.83 
 
 
585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
569 aa  130  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
576 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
586 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
564 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.85 
 
 
545 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.24 
 
 
700 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
559 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
692 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.36 
 
 
582 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.81 
 
 
575 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.23 
 
 
585 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
728 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
545 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.39 
 
 
543 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  27.66 
 
 
575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
692 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 
692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 
692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.54 
 
 
585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.28 
 
 
568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.82 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.61 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  23.86 
 
 
583 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 
583 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
551 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  23.68 
 
 
583 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  23.48 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  23.22 
 
 
552 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  23.02 
 
 
685 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
551 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
592 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 
585 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  23.26 
 
 
545 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 
570 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.43 
 
 
580 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
758 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 
579 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  22.68 
 
 
602 aa  107  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.03 
 
 
740 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  24.75 
 
 
568 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  24.78 
 
 
692 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 
742 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
540 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.78 
 
 
557 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
530 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.06 
 
 
550 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
574 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.28 
 
 
592 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 
741 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
615 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  23.99 
 
 
580 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.82 
 
 
743 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.95 
 
 
608 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.9 
 
 
574 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.65 
 
 
571 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  22.8 
 
 
574 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  25.8 
 
 
574 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>