More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2480 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
568 aa  1120    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  41.58 
 
 
539 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
545 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  33.66 
 
 
564 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
545 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
543 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
545 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.68 
 
 
551 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
563 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
569 aa  220  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  29.38 
 
 
685 aa  219  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
692 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
728 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
692 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
692 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
692 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 
700 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
741 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 
692 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
569 aa  194  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
758 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
740 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
742 aa  190  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
741 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
738 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
615 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
741 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
579 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.48 
 
 
585 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 
585 aa  156  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
585 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.19 
 
 
583 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
585 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
585 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
550 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  27.68 
 
 
583 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  28.43 
 
 
552 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  27.68 
 
 
583 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.92 
 
 
580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.49 
 
 
545 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
550 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
586 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.92 
 
 
574 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
551 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.91 
 
 
574 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  27.59 
 
 
574 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
574 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
574 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
592 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.12 
 
 
592 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
544 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
603 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 
568 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
576 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 
547 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.8 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.8 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.69 
 
 
580 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
561 aa  122  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 
575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.48 
 
 
575 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.35 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  28.29 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.98 
 
 
575 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.47 
 
 
563 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
570 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  26.7 
 
 
575 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.33 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  24.9 
 
 
575 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
551 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.75 
 
 
579 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
558 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 
533 aa  100  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.71 
 
 
556 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 
559 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.13 
 
 
551 aa  97.8  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  23.52 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
556 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  23.71 
 
 
556 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  23.71 
 
 
556 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.46 
 
 
606 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  22.94 
 
 
556 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.52 
 
 
556 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  25.83 
 
 
578 aa  94.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  25.13 
 
 
572 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 
556 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.61 
 
 
561 aa  94  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
570 aa  92.8  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 
528 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.04 
 
 
572 aa  90.5  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.35 
 
 
587 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.75 
 
 
606 aa  87.4  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>