More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000764 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  76.18 
 
 
592 aa  823    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
574 aa  1159    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  99.3 
 
 
574 aa  1154    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  73.01 
 
 
574 aa  823    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.1 
 
 
677 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.06 
 
 
580 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
568 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  50.19 
 
 
575 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  50.38 
 
 
575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
603 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  49.52 
 
 
575 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 
570 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
585 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  48.92 
 
 
592 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
585 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 
585 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.86 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.76 
 
 
574 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
574 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  43.12 
 
 
552 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  42.45 
 
 
583 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  42.45 
 
 
583 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
585 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 
585 aa  465  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  45.28 
 
 
574 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  42.83 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  42.27 
 
 
583 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  45.32 
 
 
574 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  47.25 
 
 
587 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  47.25 
 
 
587 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
586 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
550 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
550 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
533 aa  227  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
563 aa  203  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
569 aa  191  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
742 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
743 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.2 
 
 
740 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
692 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
741 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 
700 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
692 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
692 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.55 
 
 
741 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 
741 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 
741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
545 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
692 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.92 
 
 
569 aa  161  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
545 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
692 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
579 aa  157  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.73 
 
 
543 aa  150  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  27.2 
 
 
685 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
738 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  27.51 
 
 
568 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
728 aa  140  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  24.91 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
615 aa  127  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 
547 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
551 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.67 
 
 
575 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 
572 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.42 
 
 
579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.4 
 
 
551 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 
543 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.36 
 
 
576 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
544 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
559 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.35 
 
 
554 aa  101  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
541 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  29 
 
 
539 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
579 aa  98.2  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
551 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  22.26 
 
 
572 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.41 
 
 
557 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.88 
 
 
570 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.74 
 
 
561 aa  91.7  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.09 
 
 
587 aa  91.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.29 
 
 
560 aa  90.9  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.78 
 
 
558 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.7 
 
 
545 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.42 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.13 
 
 
609 aa  83.6  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
568 aa  83.6  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.17 
 
 
563 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
314 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
305 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.29 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  22.22 
 
 
575 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.8 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.37 
 
 
616 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
311 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.45 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>