More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5189 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  100 
 
 		 574 aa  1125    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  96.69 
 
 		 574 aa  1031    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  92.29 
 
 		 574 aa  967    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  84.41 
 
 		 574 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.64 
 
 		 574 aa  1021    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.83 
 
 		 580 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  58.73 
 
 		 587 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  58.73 
 
 		 587 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.43 
 
 		 677 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 		 603 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.11 
 
 		 580 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  53.39 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  53.28 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  53.07 
 
 		 575 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  49.53 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  45.28 
 
 		 574 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  45.63 
 
 		 574 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.59 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.7 
 
 		 568 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  46.39 
 
 		 574 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  48.73 
 
 		 592 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 		 585 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  40.43 
 
 		 583 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  40.28 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  40.72 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  40.28 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  40.29 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 		 550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.81 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 569 aa  193  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 		 743 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 		 545 aa  163  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.77 
 
 		 728 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 		 569 aa  159  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 		 740 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 		 742 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 		 545 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 		 615 aa  153  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  27.57 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 		 741 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  30.54 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 741 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.31 
 
 		 692 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 		 692 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 738 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  26.94 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.49 
 
 		 692 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 		 741 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 700 aa  144  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 		 692 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 		 692 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.51 
 
 		 545 aa  120  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 561 aa  120  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 		 551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  25.16 
 
 		 539 aa  114  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.77 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 		 561 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.82 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.65 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.43 
 
 		 547 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 		 616 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.96 
 
 		 572 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.53 
 
 		 576 aa  100  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 		 536 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  25.73 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 		 541 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 		 540 aa  97.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 		 558 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 		 579 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.89 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.41 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 		 557 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.52 
 
 		 609 aa  90.5  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 		 606 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.65 
 
 		 551 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.22 
 
 		 732 aa  87  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.83 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.36 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.21 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.19 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.59 
 
 		 568 aa  83.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>