More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2994 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
579 aa  1109    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
569 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
563 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
569 aa  397  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
700 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
742 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
741 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
740 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
743 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
741 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
692 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
692 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
692 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
741 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
741 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
692 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
692 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
758 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  33.53 
 
 
685 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
615 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
728 aa  287  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
738 aa  277  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
543 aa  254  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  31.97 
 
 
564 aa  251  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
545 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
545 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 
585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 
585 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  27.62 
 
 
583 aa  193  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  27.81 
 
 
583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
585 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
677 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  29.26 
 
 
552 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  27.62 
 
 
583 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
585 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.05 
 
 
545 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  33.46 
 
 
587 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  33.46 
 
 
587 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
585 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  31.13 
 
 
592 aa  183  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
576 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.42 
 
 
580 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
579 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.23 
 
 
574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 
574 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  31.27 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  26.88 
 
 
568 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
574 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.36 
 
 
574 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
592 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  25.79 
 
 
539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  29.5 
 
 
574 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 
550 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
570 aa  165  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
544 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
563 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
554 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
550 aa  161  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
580 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
586 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
545 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 
575 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.95 
 
 
575 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.78 
 
 
551 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.16 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
572 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.08 
 
 
587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
547 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
551 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  26.64 
 
 
574 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25 
 
 
556 aa  137  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.99 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
561 aa  127  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 
575 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  25.37 
 
 
556 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 
556 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  25.37 
 
 
556 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.32 
 
 
556 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
566 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
605 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  25 
 
 
572 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 
556 aa  124  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  26.5 
 
 
575 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.79 
 
 
600 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  24.63 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.45 
 
 
556 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 
556 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
564 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
540 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>