More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4475 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.8 
 
 
580 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  100 
 
 
587 aa  1160    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  100 
 
 
587 aa  1160    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.5 
 
 
574 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  57.97 
 
 
574 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 
574 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  58.73 
 
 
574 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  57.39 
 
 
574 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.92 
 
 
677 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.71 
 
 
580 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  49.73 
 
 
592 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
603 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  51.63 
 
 
575 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  48.69 
 
 
575 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  51.53 
 
 
575 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.18 
 
 
568 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  45.26 
 
 
574 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 
570 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  44.91 
 
 
574 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  50.3 
 
 
592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  47.67 
 
 
574 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 
585 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
585 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
585 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
586 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 
585 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
585 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  41.89 
 
 
583 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  43.35 
 
 
552 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  41.89 
 
 
583 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  42.25 
 
 
583 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  43.54 
 
 
545 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.45 
 
 
550 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
550 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
533 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
579 aa  200  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
563 aa  194  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
728 aa  187  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
740 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
741 aa  183  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
692 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
741 aa  182  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
741 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
743 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
700 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
741 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
692 aa  174  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
569 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
692 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
543 aa  171  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
692 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
615 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  25.98 
 
 
685 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  28.6 
 
 
568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
738 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.12 
 
 
545 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  26.14 
 
 
564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.87 
 
 
551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
551 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.17 
 
 
575 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
579 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
544 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.7 
 
 
547 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.68 
 
 
557 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  23.48 
 
 
539 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22 
 
 
545 aa  97.8  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
540 aa  97.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
576 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  24.39 
 
 
572 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.95 
 
 
554 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.89 
 
 
732 aa  93.2  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
570 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.61 
 
 
563 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 
579 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.4 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  24.95 
 
 
575 aa  91.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 
541 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
564 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.47 
 
 
559 aa  90.1  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.54 
 
 
561 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
274 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
569 aa  88.6  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
536 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 
605 aa  87.8  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.37 
 
 
566 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.47 
 
 
572 aa  87  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
314 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  29.05 
 
 
274 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1123  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  29.92 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1603  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.92 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.41 
 
 
568 aa  85.1  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>