More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0076 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.47 
 
 
600 aa  927    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.56 
 
 
602 aa  946    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89 
 
 
600 aa  961    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
600 aa  1166    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 
572 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
564 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
576 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
544 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
740 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
741 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
741 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
742 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
551 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
743 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
569 aa  130  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.08 
 
 
587 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.77 
 
 
741 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
728 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
579 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
758 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  25.92 
 
 
685 aa  111  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
692 aa  110  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
557 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.59 
 
 
564 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 
589 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 
561 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 
692 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
692 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
692 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
543 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 
569 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  25.14 
 
 
603 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
738 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.52 
 
 
545 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.29 
 
 
545 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
563 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
590 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
590 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
559 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
590 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
590 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.64 
 
 
590 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
590 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  25.79 
 
 
589 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
590 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.32 
 
 
563 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  25.79 
 
 
585 aa  100  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  27.14 
 
 
589 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 
589 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.58 
 
 
589 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
603 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
603 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 
700 aa  97.4  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
561 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
615 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
575 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 
692 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
589 aa  94.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
558 aa  94  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
589 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
592 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  25 
 
 
589 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.77 
 
 
606 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
589 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
551 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.38 
 
 
567 aa  90.9  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.49 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
550 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
562 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
550 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
550 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
558 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 
550 aa  87  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  25.95 
 
 
562 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.57 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  26.13 
 
 
570 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.51 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.73 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
663 aa  82  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.85 
 
 
572 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.22 
 
 
608 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.41 
 
 
568 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  22.5 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 
544 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.29 
 
 
522 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>