More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0434 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.33 
 
 
692 aa  1129    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
692 aa  1370    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  72.49 
 
 
700 aa  995    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.77 
 
 
692 aa  1130    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  63.5 
 
 
685 aa  843    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.65 
 
 
692 aa  1286    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.05 
 
 
692 aa  1134    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
741 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
740 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
742 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
741 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  45.36 
 
 
741 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  45.19 
 
 
741 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
743 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
758 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
615 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
728 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
569 aa  349  1e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
738 aa  337  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
569 aa  311  2e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.47 
 
 
579 aa  299  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
543 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
545 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  29.27 
 
 
568 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
551 aa  190  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.7 
 
 
551 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.04 
 
 
564 aa  188  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 
572 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  27.99 
 
 
539 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
576 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
554 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.18 
 
 
587 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.18 
 
 
587 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
579 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  28.98 
 
 
574 aa  157  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
586 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
677 aa  157  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
563 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.78 
 
 
585 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  28.71 
 
 
574 aa  154  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
592 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
559 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
585 aa  150  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  26.49 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 
585 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  26.49 
 
 
583 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
561 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.26 
 
 
583 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  26.59 
 
 
552 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 
574 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
585 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.51 
 
 
545 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.94 
 
 
574 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
575 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.99 
 
 
592 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.04 
 
 
580 aa  144  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  26.1 
 
 
556 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.18 
 
 
574 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
556 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.93 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.3 
 
 
587 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.35 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  26.1 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.01 
 
 
580 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.59 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.73 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
550 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
551 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 
575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
568 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
561 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
570 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 
556 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
586 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
603 aa  125  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  26.86 
 
 
575 aa  124  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 
556 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  26.29 
 
 
556 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  26.29 
 
 
556 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  26.17 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  26.1 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  25.92 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
556 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.85 
 
 
609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  24.27 
 
 
572 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.38 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
551 aa  117  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.65 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.92 
 
 
732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 
579 aa  114  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>