More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1098 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 741 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 758 aa  1479    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 741 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 740 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 		 743 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.11 
 
 		 741 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.31 
 
 		 741 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 		 742 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.96 
 
 		 615 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 		 728 aa  558  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 700 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 692 aa  485  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 		 692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  42.76 
 
 		 685 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 		 738 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 		 563 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 		 569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 579 aa  292  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.54 
 
 		 564 aa  204  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  29.88 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 		 677 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.48 
 
 		 551 aa  180  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 		 603 aa  179  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  28.07 
 
 		 583 aa  177  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 		 585 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  29.85 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 585 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.39 
 
 		 583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  27.69 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 585 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.41 
 
 		 545 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 		 572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.32 
 
 		 545 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 575 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.91 
 
 		 580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  29.06 
 
 		 539 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.11 
 
 		 580 aa  162  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  30.41 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 		 586 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  28.1 
 
 		 574 aa  157  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  31.56 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.71 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.71 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.5 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.57 
 
 		 592 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.94 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 563 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 		 564 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  29.77 
 
 		 574 aa  147  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 		 544 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 		 561 aa  144  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 		 550 aa  144  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 		 550 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  29.98 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 		 574 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.93 
 
 		 574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.28 
 
 		 559 aa  138  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.73 
 
 		 574 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.51 
 
 		 608 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.62 
 
 		 587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  26.31 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 		 556 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 		 575 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 		 732 aa  124  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.49 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 		 602 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 		 606 aa  119  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.96 
 
 		 609 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 		 561 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 		 605 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 		 616 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 		 600 aa  110  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.52 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 570 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  21.83 
 
 		 572 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 		 586 aa  107  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  24.35 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>