More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0376 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
539 aa  1050    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
545 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  41.24 
 
 
568 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.49 
 
 
551 aa  281  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
543 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
545 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  30.2 
 
 
564 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
569 aa  204  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  29.41 
 
 
685 aa  192  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 
700 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
569 aa  183  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
728 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
758 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
692 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
692 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
692 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
742 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
741 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
692 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
743 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 
741 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
615 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
551 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
740 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 
741 aa  154  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 
741 aa  153  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 
738 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 
572 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
550 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  25.26 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.94 
 
 
579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.01 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
561 aa  114  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
586 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.26 
 
 
547 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 
585 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.16 
 
 
580 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  25.04 
 
 
585 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  24.54 
 
 
583 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.08 
 
 
574 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.62 
 
 
583 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.88 
 
 
545 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  26.11 
 
 
552 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  24.35 
 
 
583 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.32 
 
 
585 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  24.74 
 
 
574 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.43 
 
 
574 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.34 
 
 
544 aa  104  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.2 
 
 
574 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
568 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  27.8 
 
 
574 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.58 
 
 
592 aa  100  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  22.79 
 
 
575 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
592 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
574 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.5 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  23.09 
 
 
575 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.69 
 
 
533 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
609 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
605 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.44 
 
 
574 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.51 
 
 
557 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 
579 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.8 
 
 
561 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  23.3 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.71 
 
 
603 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  23.65 
 
 
575 aa  87.8  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.35 
 
 
568 aa  87  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.01 
 
 
528 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.44 
 
 
677 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.08 
 
 
611 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.35 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.64 
 
 
592 aa  84  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  25.68 
 
 
574 aa  83.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.26 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.05 
 
 
580 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  22.38 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.03 
 
 
563 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  22.4 
 
 
585 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  22.2 
 
 
589 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.2 
 
 
589 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  22.27 
 
 
556 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.56 
 
 
606 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.83 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.62 
 
 
589 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.82 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 
556 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.55 
 
 
732 aa  78.2  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.99 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  21.74 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.99 
 
 
608 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>