More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4451 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
586 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  30.67 
 
 
578 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
561 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 
589 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  28.22 
 
 
585 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 
589 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  28.16 
 
 
589 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.16 
 
 
589 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
590 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  27.35 
 
 
590 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  27.67 
 
 
589 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
590 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
575 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
590 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
590 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
590 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
590 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
559 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.4 
 
 
558 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
564 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
563 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
559 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
692 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.26 
 
 
557 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  29.09 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  26.19 
 
 
700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
605 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
579 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
616 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
568 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  26.26 
 
 
685 aa  125  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  24.92 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.27 
 
 
556 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 
556 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.43 
 
 
603 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  24.91 
 
 
603 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  26.88 
 
 
589 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
589 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
589 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 
597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
589 aa  113  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
571 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
545 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
551 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.8 
 
 
742 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 
692 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
576 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
545 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
592 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
557 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
758 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
543 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
543 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.02 
 
 
587 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
740 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.28 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
728 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  25.05 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.48 
 
 
743 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  25.05 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  24.62 
 
 
556 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.87 
 
 
551 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
741 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
579 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
608 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
551 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  24.6 
 
 
556 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
741 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
556 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
564 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
741 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
608 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
540 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
741 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
588 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.62 
 
 
582 aa  97.4  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.39 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
551 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
615 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
544 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
611 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.06 
 
 
585 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.29 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 
533 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 
602 aa  87.4  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
575 aa  87.4  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>