More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1376 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  70.21 
 
 		 603 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.2 
 
 		 557 aa  746    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  100 
 
 		 589 aa  1154    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.12 
 
 		 590 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  61.42 
 
 		 589 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.01 
 
 		 590 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  62.98 
 
 		 590 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  60.85 
 
 		 585 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.21 
 
 		 603 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 589 aa  1154    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  63.12 
 
 		 589 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 589 aa  1154    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.3 
 
 		 590 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.01 
 
 		 590 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.12 
 
 		 590 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.01 
 
 		 590 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.9 
 
 		 589 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.21 
 
 		 603 aa  828    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  61.59 
 
 		 589 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  61.25 
 
 		 589 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.72 
 
 		 589 aa  1096    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  59.63 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  31.72 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 579 aa  246  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  26.27 
 
 		 578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 		 568 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.36 
 
 		 605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.28 
 
 		 563 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 		 561 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 		 570 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.17 
 
 		 569 aa  128  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 		 559 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 		 616 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 		 575 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.38 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.39 
 
 		 566 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.24 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 		 559 aa  114  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.25 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.75 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  21.53 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 		 563 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.47 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.83 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  21 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 		 582 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.22 
 
 		 569 aa  104  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.45 
 
 		 554 aa  104  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  21.62 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.36 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 		 608 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.31 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.08 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  21.53 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.34 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  21 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  21.35 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  21.35 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  21.35 
 
 		 556 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.47 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 		 579 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.37 
 
 		 588 aa  97.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.42 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  30.3 
 
 		 575 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.68 
 
 		 576 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 568 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.12 
 
 		 592 aa  93.6  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.73 
 
 		 743 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 		 536 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 		 741 aa  90.5  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3200  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.49 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  23.98 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 		 550 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.24 
 
 		 741 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  25.44 
 
 		 553 aa  87.8  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 600 aa  87.4  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.87 
 
 		 692 aa  87.4  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.34 
 
 		 530 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 		 600 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 		 550 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.03 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.85 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.02 
 
 		 741 aa  85.1  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.74 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.6 
 
 		 692 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  21.33 
 
 		 685 aa  83.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>