More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2735 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.79 
 
 
559 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.09 
 
 
564 aa  962    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
564 aa  1091    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
560 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.1 
 
 
568 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.67 
 
 
570 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
575 aa  364  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3200  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.69 
 
 
574 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
563 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  29.64 
 
 
589 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 
589 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
590 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
590 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
590 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  29.61 
 
 
589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
590 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 
590 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.61 
 
 
589 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
561 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
590 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
589 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  29.06 
 
 
585 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
558 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
559 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  29.3 
 
 
575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.15 
 
 
589 aa  147  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
561 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
592 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  26.86 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
603 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
603 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
589 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 
589 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  25.75 
 
 
589 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
557 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
597 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 
551 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.92 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.48 
 
 
609 aa  131  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  26.73 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  26.38 
 
 
572 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 
579 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 
551 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
616 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.92 
 
 
556 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
551 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 
556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.87 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.32 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.82 
 
 
554 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.64 
 
 
572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.5 
 
 
528 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 
556 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
521 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
521 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
582 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.92 
 
 
741 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
611 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  22.97 
 
 
556 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.29 
 
 
556 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  23.08 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  23.08 
 
 
556 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.65 
 
 
547 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
579 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
533 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
540 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
568 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  22.2 
 
 
741 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.92 
 
 
742 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  24.69 
 
 
564 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
561 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  22.2 
 
 
741 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.03 
 
 
545 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.08 
 
 
569 aa  100  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  22.42 
 
 
602 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
585 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.37 
 
 
608 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.67 
 
 
545 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.12 
 
 
740 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
521 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.79 
 
 
576 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
544 aa  97.8  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.7 
 
 
589 aa  97.8  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
493 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.574185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.04 
 
 
575 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
552 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>