More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0640 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.43 
 
 		 692 aa  838    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.83 
 
 		 692 aa  832    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  64.01 
 
 		 700 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  100 
 
 		 685 aa  1349    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.76 
 
 		 692 aa  839    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 		 692 aa  830    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  63.06 
 
 		 692 aa  836    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 740 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 		 742 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 		 743 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 		 741 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 		 758 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  43.52 
 
 		 741 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 		 741 aa  459  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 		 741 aa  452  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 		 615 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 		 728 aa  412  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 		 569 aa  333  9e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 		 738 aa  333  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 		 563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 		 569 aa  323  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 		 543 aa  297  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  29.03 
 
 		 564 aa  226  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  29.53 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 554 aa  197  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.64 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  29.66 
 
 		 539 aa  190  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 		 545 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.8 
 
 		 579 aa  171  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 		 572 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 		 677 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 		 561 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 585 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.12 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 		 585 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 		 574 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 		 559 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 585 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  27.24 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  27.62 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.33 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  27.39 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.11 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.24 
 
 		 545 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.67 
 
 		 580 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.35 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  26.26 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 		 544 aa  142  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.8 
 
 		 587 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 574 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.85 
 
 		 587 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.85 
 
 		 587 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  27.25 
 
 		 574 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 		 570 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 		 550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  26.83 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  26.83 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.05 
 
 		 580 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  26.83 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 556 aa  127  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  31.63 
 
 		 575 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 		 575 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 		 603 aa  127  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 		 550 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 		 556 aa  127  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.95 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.49 
 
 		 561 aa  126  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 		 551 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 556 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.83 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 		 586 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.43 
 
 		 547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.88 
 
 		 592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 		 609 aa  114  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  24.53 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.39 
 
 		 564 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 533 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 		 616 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.95 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 		 606 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>