More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3589 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
564 aa  1088    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
576 aa  283  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
579 aa  279  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
572 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
732 aa  210  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
600 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
602 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
600 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
600 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.29 
 
 
544 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
606 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
569 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
563 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
742 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.61 
 
 
545 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
547 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
559 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
563 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
543 aa  156  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.46 
 
 
554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 
741 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
743 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 
741 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
545 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
740 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
561 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 
741 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
692 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
741 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
634 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.78 
 
 
587 aa  137  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  28.27 
 
 
575 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.2 
 
 
728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
692 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
692 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
692 aa  133  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  24.59 
 
 
685 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
558 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  28.02 
 
 
589 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
590 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
590 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
700 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
590 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  26.79 
 
 
590 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
551 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  26.94 
 
 
585 aa  123  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
590 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
590 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
575 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
692 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.14 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  27.14 
 
 
589 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
590 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  28.85 
 
 
564 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
615 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
564 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
541 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 
606 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.77 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
557 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 
738 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
605 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 
585 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.49 
 
 
269 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  24.4 
 
 
583 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
585 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  24.4 
 
 
552 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.37 
 
 
531 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.59 
 
 
556 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  24.4 
 
 
583 aa  107  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.01 
 
 
585 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.71 
 
 
585 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  25.67 
 
 
572 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.91 
 
 
669 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
585 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
608 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.88 
 
 
547 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.08 
 
 
562 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
530 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
521 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.2 
 
 
545 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
677 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
521 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.62 
 
 
561 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
572 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
259 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>