More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3809 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  74.91 
 
 		 536 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  75 
 
 		 536 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 535 aa  1055    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  74.72 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  720    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  74.91 
 
 		 536 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  74.91 
 
 		 536 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 		 536 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  76.07 
 
 		 535 aa  782    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  77.38 
 
 		 535 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  75.19 
 
 		 536 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  75 
 
 		 536 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  97.2 
 
 		 535 aa  961    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  76.26 
 
 		 535 aa  784    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  76.64 
 
 		 536 aa  733    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  74.72 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  74.81 
 
 		 536 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  74.81 
 
 		 536 aa  718    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  77.43 
 
 		 537 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  76.45 
 
 		 535 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  47.09 
 
 		 516 aa  438  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  46.21 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  44.62 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  46.11 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  47.67 
 
 		 530 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  41.14 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  42.42 
 
 		 543 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  42.49 
 
 		 541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  41.04 
 
 		 545 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  40.82 
 
 		 531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  40.34 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  38.11 
 
 		 521 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  38.22 
 
 		 523 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  37.63 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  37.01 
 
 		 504 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  36.14 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 		 606 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 		 663 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 		 634 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 		 565 aa  97.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21.7 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.03 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.63 
 
 		 278 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.46 
 
 		 279 aa  87.4  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 		 572 aa  87  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.6 
 
 		 285 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.6 
 
 		 285 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 		 564 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.68 
 
 		 288 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.25 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.28 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.25 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.38 
 
 		 299 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.38 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.9 
 
 		 306 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0611  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.36 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.03 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.7 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.58 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.42 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.43 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  26.47 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  28.25 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  28.63 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.64 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.14 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30 
 
 		 278 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3692  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.9 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.33 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.35 
 
 		 276 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 		 222 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.75 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.33 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.43 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.89 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.43 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.43 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.56 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.421678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>