More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0729 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.79 
 
 
261 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  70.08 
 
 
265 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  69.7 
 
 
265 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.62 
 
 
261 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  69.32 
 
 
265 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.32 
 
 
265 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.15 
 
 
264 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.75 
 
 
268 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.42 
 
 
266 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 
264 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 
264 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.86 
 
 
264 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  60.54 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  57.09 
 
 
262 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  52.96 
 
 
259 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  52.57 
 
 
259 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 
259 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
574 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  32.23 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
263 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
287 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
263 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
262 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
267 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
261 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
301 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.98 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 
263 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
263 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  29.41 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  28.99 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  34.75 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
259 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  32.38 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
300 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  27.57 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  26.39 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.65 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  25.84 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  30.51 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.39 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.89 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2665  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  30.37 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0357719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>