More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0498 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.49 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
267 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  68.27 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.87 
 
 
263 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.71 
 
 
262 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  65.12 
 
 
272 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  65.12 
 
 
272 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.53 
 
 
262 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.48 
 
 
262 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.14 
 
 
260 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.87 
 
 
263 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  64.66 
 
 
263 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.66 
 
 
263 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  57.2 
 
 
283 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.08 
 
 
259 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.08 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.83 
 
 
261 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
271 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  40.79 
 
 
252 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
259 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
285 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  36.05 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  34.52 
 
 
265 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.26 
 
 
266 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
264 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  34.01 
 
 
265 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  35.47 
 
 
265 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
278 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  33.5 
 
 
262 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.88 
 
 
265 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
259 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  33.5 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  29.61 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  31.9 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.75 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28030  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.69 
 
 
578 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
579 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.9 
 
 
221 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
574 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.9 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.56 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  34.29 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.74 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
564 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.03 
 
 
569 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.99 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.88 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>