More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0348 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
263 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.2 
 
 
263 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.6 
 
 
260 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.63 
 
 
267 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.2 
 
 
262 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
262 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.05 
 
 
262 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  66.67 
 
 
272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 
272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  64.39 
 
 
263 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.39 
 
 
263 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.12 
 
 
263 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.66 
 
 
260 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  57.72 
 
 
283 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
259 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
259 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 
261 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  43.23 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
271 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
258 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
258 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
258 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
301 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  29.04 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  33.16 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
264 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
264 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  32.69 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.21 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  29.8 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.66 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  33.16 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  25.88 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.21 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  30.25 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28030  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.44 
 
 
578 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  29.24 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.39 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.49 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.46 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.88 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  34.39 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
579 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  34.68 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  34.68 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.9 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  34.68 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.96 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
564 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  33.87 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.14 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163733  normal  0.0234889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  27.55 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  26.58 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.09 
 
 
297 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>