More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0831 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
260 aa  504  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  77.6 
 
 
263 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.6 
 
 
263 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.6 
 
 
263 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.12 
 
 
267 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.52 
 
 
262 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  68.53 
 
 
272 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 
272 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.77 
 
 
262 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.02 
 
 
262 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  69.11 
 
 
263 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.11 
 
 
263 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.29 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.14 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  59.5 
 
 
283 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.04 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.43 
 
 
259 aa  285  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.84 
 
 
261 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  40.52 
 
 
252 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
271 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
258 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
258 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
258 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
252 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
259 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
285 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  35.36 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
278 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 
259 aa  102  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  33.5 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  33.82 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  33.33 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.21 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
259 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.14 
 
 
265 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  32.49 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  30.86 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
574 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  30.91 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.6 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
579 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.18 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28030  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.72 
 
 
578 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  30.67 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  28.21 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  36.31 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.47 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  28.21 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  31.07 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  27.22 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
732 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
608 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  25.23 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.65 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  28.17 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.52 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  29.91 
 
 
265 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>