More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3397 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  535  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.18 
 
 
304 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 
300 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
261 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
268 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  32.27 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  34 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
261 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.5 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.03 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  29.9 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
366 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
262 aa  89  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
362 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
362 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
362 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
366 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  29.09 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
576 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 
410 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  30.85 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  27.78 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  30.85 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4467  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.73 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.380773  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  26.67 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
213 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  30.38 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  35.14 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
579 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.27 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
264 aa  79  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  26.88 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.88 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.85 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  27.31 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  40.97 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  31.6 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  31.03 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>