More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2899 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.18 
 
 
262 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.88 
 
 
262 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.36 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  74.42 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  74.42 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 
263 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  71.43 
 
 
263 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.87 
 
 
263 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.02 
 
 
260 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.05 
 
 
263 aa  358  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  67.05 
 
 
263 aa  358  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.05 
 
 
263 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.53 
 
 
260 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  58.92 
 
 
283 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.86 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.86 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
261 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  39.04 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
258 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
258 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
258 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
252 aa  151  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
271 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  33.05 
 
 
284 aa  125  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
285 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  33.5 
 
 
265 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  32.49 
 
 
262 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
259 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
259 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  32.49 
 
 
265 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.48 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
268 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  30.95 
 
 
265 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  30.96 
 
 
262 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.95 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
264 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
261 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  28.4 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  26.15 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
579 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.77 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.98 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  27.81 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.76 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.69 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  28.31 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.19 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.1 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 
556 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  28.96 
 
 
556 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.08 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  30.38 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
294 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  25.79 
 
 
265 aa  62  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28030  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.46 
 
 
578 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
564 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  27.36 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>