More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2473 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
261 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  51.34 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.59 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.37 
 
 
272 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  51.37 
 
 
272 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.44 
 
 
267 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.84 
 
 
260 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
263 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
262 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 
263 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  48.47 
 
 
263 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  47.31 
 
 
283 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.83 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  44.03 
 
 
252 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
258 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
258 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
258 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
259 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
301 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
285 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  32.42 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.88 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  29.74 
 
 
262 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  31.42 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  30 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.97 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 
259 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
259 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  31.03 
 
 
262 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 
259 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  29.57 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
278 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 
259 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.87 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
574 aa  79  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.54 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  32.7 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  25.62 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  32.92 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  31.05 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.08 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0828593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.87 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.17 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  30.82 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  28.57 
 
 
282 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  29.59 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  27.16 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
315 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  32.91 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  28.64 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.21 
 
 
289 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1442  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  24.42 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
362 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>