More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1647 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
262 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.14 
 
 
262 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
260 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.22 
 
 
259 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
262 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1465  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  40.59 
 
 
262 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 
264 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
264 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
264 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
268 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
264 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
264 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
264 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
264 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
264 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
264 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.16 
 
 
264 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
263 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
264 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  34.31 
 
 
265 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  34.38 
 
 
264 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  37.93 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  34.16 
 
 
265 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
264 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
264 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
268 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.26 
 
 
264 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7195  ABC transporter permease  33.47 
 
 
271 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
262 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
287 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1588  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.91 
 
 
279 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
264 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.28 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
275 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6500  ABC transporter permease  31.76 
 
 
264 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
272 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
266 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
269 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.53 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
277 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
265 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176391  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  33.05 
 
 
266 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
669 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
266 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
265 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
279 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0828593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1507  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
264 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375803  normal  0.0420414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0498  putative sperimidine/putrescine ABC transporter (permease protein)  35.04 
 
 
265 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  29.55 
 
 
266 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
269 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
268 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
269 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
267 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673957  normal  0.0589597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
268 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
275 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
279 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  35.05 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  29.55 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  29.67 
 
 
260 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
274 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
268 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.344703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  31.72 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
606 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
279 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2209  putrescine ABC transporter permease  32.37 
 
 
264 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.052298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  35.05 
 
 
276 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3185  ABC transporter permease  32.91 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  33.47 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  33.47 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0758947  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.41 
 
 
271 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>