More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5740 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
252 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.43 
 
 
259 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.62 
 
 
258 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.62 
 
 
258 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.62 
 
 
258 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  45.12 
 
 
284 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
301 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
263 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
262 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
263 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
262 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
262 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  41.55 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
267 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
263 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  36.59 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  39.52 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
259 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
260 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
259 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.17 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  35.51 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  33.03 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  32.58 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.06 
 
 
266 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.03 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  32.13 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  30.18 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  27.9 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  31.96 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  32.35 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  33.33 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  30.24 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  26.64 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.76 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  27.91 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
312 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.63 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.97 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  25.86 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  27.98 
 
 
226 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
300 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
298 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  32.29 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  32.29 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.37 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367092  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  28.43 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.21 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  23.41 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>