More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0749 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.79 
 
 
261 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  70.08 
 
 
265 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  69.7 
 
 
265 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.23 
 
 
261 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  68.56 
 
 
265 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.56 
 
 
265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.42 
 
 
266 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.36 
 
 
268 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.36 
 
 
264 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 
264 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 
264 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.1 
 
 
264 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  60.15 
 
 
262 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  56.7 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  53.36 
 
 
259 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  52.96 
 
 
259 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  45.98 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
574 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
278 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  30.71 
 
 
263 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
262 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
267 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
261 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
263 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
262 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
301 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
287 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.96 
 
 
260 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  34.75 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  29.1 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  27.17 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
263 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  28.5 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  32.23 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
259 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  28.11 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  25.65 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.38 
 
 
587 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
587 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.11 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  27.4 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  25.28 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.25 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.81 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.81 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.81 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  29.13 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  25.09 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3184  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.29 
 
 
289 aa  72  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0224874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.3 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.18 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  32.69 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>