More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1415 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  98.85 
 
 
347 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
366 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  98.63 
 
 
366 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  98.09 
 
 
362 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  98.09 
 
 
362 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  98.09 
 
 
362 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  90.2 
 
 
410 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.88 
 
 
298 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.68 
 
 
300 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  97.98 
 
 
243 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.58 
 
 
312 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  78.62 
 
 
300 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.52 
 
 
298 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.51 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  86.25 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.6 
 
 
265 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.8 
 
 
265 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  71.6 
 
 
265 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  64.62 
 
 
291 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.96 
 
 
268 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.94 
 
 
261 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.7 
 
 
261 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.15 
 
 
261 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
262 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  60.08 
 
 
261 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.19 
 
 
294 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59 
 
 
265 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.26 
 
 
266 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  61.92 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.92 
 
 
264 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00110867  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  34.6 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
262 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
262 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  33.47 
 
 
265 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7601  ABC transporter membrane spanning protein  34.17 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
272 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
264 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
269 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  31.07 
 
 
264 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
295 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7195  ABC transporter permease  32.2 
 
 
271 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 
300 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  30.04 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.51 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
269 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
276 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
278 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
266 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
265 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.225733  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 
265 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
264 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
280 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
279 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
282 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
268 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  30.21 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
261 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.722828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  32.09 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  32.81 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  31.37 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
606 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  28.31 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>