More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3073 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
284 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  55.98 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.414706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.13 
 
 
266 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  41.13 
 
 
266 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.49 
 
 
269 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 
268 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  41.13 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
268 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
268 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
267 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  40.76 
 
 
260 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
264 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
268 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.53 
 
 
266 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
278 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.722828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  36.51 
 
 
276 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
273 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0526069  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.93 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1731  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000945918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  41.34 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
272 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2048  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
264 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000240578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  39.92 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.32 
 
 
264 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01400  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1527  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
269 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682654  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01411  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.98 
 
 
256 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1622  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
264 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
261 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  38.31 
 
 
273 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
281 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.19 
 
 
256 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  41.34 
 
 
286 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  41.1 
 
 
260 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
277 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
269 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.66 
 
 
276 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  37.94 
 
 
293 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  41.98 
 
 
258 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
274 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
271 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  hitchhiker  0.00965408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.4 
 
 
256 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.1 
 
 
257 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.73 
 
 
256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  41.02 
 
 
273 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
279 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 
273 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  38.4 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  40.96 
 
 
273 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 
262 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
269 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  37.9 
 
 
272 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
287 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  41.7 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  41.7 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  38.34 
 
 
272 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
268 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.764612  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
258 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.91 
 
 
244 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
259 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  38.03 
 
 
270 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
268 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0038105  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
282 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
270 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
268 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  36.95 
 
 
271 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
275 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  36.95 
 
 
271 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 
287 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  36.95 
 
 
271 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  36.95 
 
 
271 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0016  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.4 
 
 
268 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
272 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
274 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  39.24 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.37 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
271 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>