More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4356 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
254 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 
282 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 
282 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 
282 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 
282 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  57.83 
 
 
282 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 
315 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 
315 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  57.83 
 
 
282 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  57.83 
 
 
282 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.16 
 
 
283 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  32.14 
 
 
265 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  31.39 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.31 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  32.31 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
268 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 
266 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  29.95 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.91 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.59 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  27.44 
 
 
262 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
312 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
280 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
261 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  29.72 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  28.64 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  26.05 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
347 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
366 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1465  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  29.63 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  31 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4467  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.25 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.380773  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5282  ABC transporter  28.82 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  26.25 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673957  normal  0.0589597 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
588 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  31.71 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
263 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27.67 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
596 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  26.05 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>