More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2227 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  45.02 
 
 
265 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  43.08 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  46.41 
 
 
257 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  46.31 
 
 
263 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  40 
 
 
266 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  39.6 
 
 
266 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  40.48 
 
 
266 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  42.23 
 
 
266 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  43.4 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  39.15 
 
 
260 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  38.37 
 
 
260 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  40.79 
 
 
260 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  40.72 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  41.89 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
213 aa  152  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  37.25 
 
 
261 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
258 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  32.94 
 
 
261 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.27 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.18 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  36.15 
 
 
270 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
222 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37.37 
 
 
269 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  32.56 
 
 
270 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.92 
 
 
275 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  35.94 
 
 
230 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
241 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  37.86 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  37.19 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
223 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.17 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  34.13 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  33.18 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.77 
 
 
315 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.87 
 
 
308 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  38.73 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.16 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.77 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
221 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.16 
 
 
270 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.65 
 
 
270 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.64 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
286 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
230 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
221 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
255 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.13 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.13 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.13 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4912  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  35.03 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.09 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  28.84 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  30.92 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.77 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0883923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  33.63 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.23 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  34.68 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
325 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.343545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 
226 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.64 
 
 
278 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
230 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.68 
 
 
285 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
230 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  35.86 
 
 
269 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.66 
 
 
271 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  31.31 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.68 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 
226 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 
287 aa  109  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  31.53 
 
 
278 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.05 
 
 
278 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
221 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  37.82 
 
 
292 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.06 
 
 
291 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.57 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.68 
 
 
288 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.4 
 
 
279 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
221 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
224 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  33.33 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>