More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000664 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  100 
 
 
262 aa  523  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  86.26 
 
 
262 aa  447  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  67.33 
 
 
265 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.33 
 
 
265 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  64.54 
 
 
265 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  64.14 
 
 
265 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.27 
 
 
266 aa  347  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.34 
 
 
264 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.77 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.81 
 
 
264 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.81 
 
 
264 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.18 
 
 
264 aa  328  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.4 
 
 
261 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.54 
 
 
261 aa  318  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.15 
 
 
261 aa  318  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  56.03 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  55.6 
 
 
259 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 
259 aa  235  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
574 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
278 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  37.06 
 
 
263 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
263 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
261 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  35.19 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  33.16 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
262 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.5 
 
 
260 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
260 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
272 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  32.49 
 
 
272 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  32.2 
 
 
283 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  26.58 
 
 
282 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 
282 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
282 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
301 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  29.13 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.89 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
254 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.225733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  30.7 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  25.4 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.15 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0016  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.58 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  27.24 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  33.02 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.45 
 
 
587 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  27.93 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  33.68 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.71 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  27.17 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  28.83 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  27.48 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
587 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  31.07 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  28.22 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2665  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  29.47 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0357719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  28.07 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  26.91 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>