More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0911 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 263 aa  520  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  37.92 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.36 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  39.58 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  36.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  35.34 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  36.19 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  36.96 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  36.05 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  36.49 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  36.36 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  37.8 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  36.61 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  37.96 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  37.96 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.54 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  35.98 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  36.19 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  35.34 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  35.86 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  38.68 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  37.69 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  35.86 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.41 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  36.73 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.41 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  35.23 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.41 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 		 272 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  36.17 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  35.97 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  35.45 
 
 		 269 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.32 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.34 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  39.38 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  35 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  35.95 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7680  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 313 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal  0.115465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  36.86 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.04 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2908  ornithine carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.979336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3018  ornithine carbamoyltransferase  35.46 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6348  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2811  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.8 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  35.55 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  37.66 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1276  ornithine carbamoyltransferase  35.16 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  0.197685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  38.5 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163733  normal  0.0234889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>