More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1827 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.66 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.183467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 		 253 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.385129  hitchhiker  0.0000000000432585 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.1 
 
 		 253 aa  371  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  31.3 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  30.17 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.4 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.46 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  31.95 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.38 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  29.63 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  31.06 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  30.08 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  31.58 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  31.78 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  31.14 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.74 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  32.41 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  32.11 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1906  putrescine transport system permease protein  31.4 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  31.75 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  34.51 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  33 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  33 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  31.85 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  30.38 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  28.27 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  30.65 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  32.02 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  32.17 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  32.17 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  32.17 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  30.59 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  32.17 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  28.75 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 292 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  34.21 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  32.95 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.8 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0688  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  27.23 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  27.78 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.79 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1733  ornithine carbamoyltransferase  30.87 
 
 		 279 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1141  hypothetical protein  28.16 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  32.48 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00456  putrescine transport protein; permease  32.49 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.033567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  32.48 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  31.86 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  32.38 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163733  normal  0.0234889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 		 272 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  32.46 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  30.77 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.75 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.54 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  30.12 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.12 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.12 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.12 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>